肿瘤精准检测是指利用基因组学、表观遗传组学、转录组学、蛋白组学、代谢组学等组学检测技术,获取肿瘤相关的生物学信息,进一步分析组学检测结果对肿瘤筛查与诊疗的临床应用价值。其中,多基因突变检测指利用二代测序(next generation sequencing,NGS)技术,将多个基因对应的探针设计到同一张捕获芯片上以捕获目标肿瘤或者胚系DNA,并结合后续的测序分析检测肿瘤中的突变基因、突变类型与突变位点等相关信息。
多基因突变检测应当由具备NGS与分析资质的机构提供精准的检测服务,并对乳腺癌发生、发展过程中的遗传易感性基因(BRCA1/2等)、高频突变基因、靶向用药相关基因和耐药相关基因等多类基因进行突变检测,检测结果应由专业人员结合患者具体情况进行合理解读。多基因突变检测对于乳腺癌罹患风险预测、乳腺癌(尤其是三阴性乳腺癌)的分子分型和精准治疗方案选择具有重要参考意义。
在临床实践中推荐对以下3类患者行多基因突变检测:①有肿瘤相关个人史或家族史,提示基因相关的肿瘤易感性;②能够充分解释精准检测结果;③检测结果有助于临床筛查、诊疗的应用。当前针对乳腺癌的多基因突变检测主要应用于晚期多线治疗方案失败的患者中(推荐结合临床试验进行),辅助临床医师发现这部分乳腺癌患者的相关基因突变信息,并对肿瘤患者进行精准分型与治疗靶点的精确定位,进而选择可能有效的治疗策略与治疗药物。
包括多基因突变检测在内的精准检测在乳腺癌诊断与治疗中有广阔的应用前景,也将随着各类组学检测技术的发展和相关证据的累积,在临床实践中发挥更加重要的作用。精准检测对于三阴性乳腺癌的精准治疗具有重要价值。三阴性乳腺癌是一群异质性肿瘤,可基于基因表达谱分成不同的分子亚型。
目前认可度较高的分型系统包括Lehmann六分型、Burstein四分型和“复旦分型”,其中“复旦分型”系统具有多组学融合的特点和后续完整的临床验证过程,具有较高的临床转化价值。“复旦分型”系统将三阴性乳腺癌分为基底样免疫抑制型(BLIS)、免疫调节型(IM)、腔面雄激素受体型(LAR)和间充质样型(MES)。各亚型均存在特异性基因组和转录组改变,有对应的潜在治疗靶点。
临床实践中可基于AR、FOXC1、CD8和DCLK1这4个亚型特异性标志物的免疫组织化学染色结果,按照如下的分型流程(图4),准确区分“复旦分型”的各个亚型,实现“复旦分型”从多组学大数据分析到临床应用的转化。在精准分型的基础上通过多基因突变检测,可鉴定“复旦分型”中各亚型特异的基因组变异,为临床医师开展精准治疗提供参考。
目前推荐在晚期三阴性乳腺癌中开展“复旦分型”和多基因突变检测,针对亚型特异性靶点开展精准治疗,实现三阴性乳腺癌“分子分型基础上的精准治疗”,进而改善患者预后。如在IM亚型患者中使用抗PD-1单抗免疫治疗联合白蛋白结合型紫杉醇,在具有ERBB2激活突变的LAR亚型患者中使用吡咯替尼联合卡培他滨,均在多线治疗失败的三阴性乳腺癌患者中取得了显著疗效。
基于基因组和转录组建立的“复旦分型”系统仍在不断完善之中。表观遗传组学、转录组学、蛋白组学、代谢组学等多维度的组学检测和更精细的单细胞层面检测是优化“复旦分型”的新手段,将助力更精准的“复旦分型”系统和更多元化的精准治疗靶点,人工智能联合影像组学和病理组学分析将助力实现临床快捷简便的“复旦分型”。
参考:《中国癌症杂志》2021年第31卷第10期