约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的研究人员正在开发一种新型的自动液体活检测试方法,这种测试方法可以在五小时内准确检测转移性乳腺癌患者血液中是否存在癌症DNA。虽然这项测试方法目前只是一个研究用途的原型,但它有望帮助肿瘤医生快速确定癌症治疗是否有效。
这种测试方法被称为乳腺癌甲基化液体活检(LBx-BCM),可与一种名为GeneXpert®的商用分子检测平台兼容,可以在4.5小时内检测到甲基化——乳腺癌的9个基因变异中存在的一种化学标签。它需要实验室技术人员手工操作的时间<15分钟。该测试及其潜在用途的验证于5月6日在线发表在《Cancer Research Communications》杂志上。
该研究的高级作者、约翰霍普金斯大学医学院肿瘤学和病理学教授Saraswati Sukumar博士解释说,许多乳腺癌患者对化疗没有反应,但在肿瘤团队进行影像检查确定治疗是否有效之前,他们要经过多个周期的治疗。Sukumar说,影像检查可以有效地检测较大肿瘤的变化,但几乎不能鉴别较小肿瘤的变化。
Sukumar说:“我们的目标是开发一种既精细又简单的检测方法,可以在全球范围内推广,可以床旁使用,向临床医生和患者提供当天的反馈。如果我们能够通过这种卡盒式测试证明,我们的确成功地预测了治疗过程,我们可能改变我们看待化疗的方式,以及我们治疗转移性乳腺癌患者的方式。”
通过与Cephied的科学家合作开发的LBx-BCM测试,技术人员可以将癌症患者的血液或血浆样本放入含有试剂(一种用于提取DNA的混合物)的试管中,并将内容物放入商用系统的盒中,对DNA进行化学修饰,然后扩增和检测甲基化基因,快速反馈结果。该检测在四种乳腺癌亚型特有的9个基因中寻找甲基化标志物(癌细胞特有的DNA的化学改变)。这些基因是AKR1B1、TM6SF1、ZNF671、TMEFF2、COL6A2、HIST1H3C、RASGRF2、HOXB4和RASSF1。
约翰霍普金斯大学的研究小组此前开发了一种名为cMethDNA的液体活检实验室分析方法,该方法可以识别乳腺癌10个变异基因中的高甲基化。高甲基化是DNA的一种化学变化,它通常会使控制失控细胞生长的基因功能沉默。如果它出现在血液中乳腺癌相关基因的DNA中,表明癌症已经复发或扩散。该测试可以检测高达90%的转移性乳腺癌患者,并有助于预测治疗的反应和患者的长期预后。但它需要10天才能完成,对技术能力的要求很高。该研究的首席作者Mary Jo Fackler博士说,LBx-BCM建立在这项技术的基础上,而且由于它是自动化的,花费的时间要少得多。
为了测试LBx-BCM,研究人员首先让两名操作者在不同的时间进行测试,他们使用了11名转移性乳腺癌患者和4名非乳腺癌患者的储存样本。90%以上的病例结果相同。
他们还采用约翰霍普金斯之前研究的两套样本,研究了该测试方法检测转移性乳腺癌的能力。他们检测了转移性乳腺癌患者的20份血清样本和非乳腺癌患者的20份血清样本中9种基因的累积甲基化。研究人员分析了来自40例转移性乳腺癌患者、17例良性乳腺癌患者和9例非患乳腺癌患者的第2组样本。在这两组样本中,LBx-BCM在乳腺癌患者血浆样本中检测到的甲基化DNA是正常或良性样本的2 - 200倍。
研究人员发现该检测正确检测癌症的几率为83%,正确排除癌症的几率为92%,总体诊断准确率为85%。
Sukumar及其同事写道:“进一步的前瞻性临床试验将评估LBx-BCM的检测灵敏度,及其在晚期乳腺癌治疗期间监测治疗反应的能力。”
原文链接:
https://www.hopkinsmedicine.org/news/newsroom/news-releases/liquid-biopsy-detects-dna-markers-in-advanced-breast-cancer-within-five-hours